藻类在水产养殖中具有重要作用，能提供幼苗饵料，增加水体溶氧量，净化水质等，这一点与化学增氧改底产品过硫酸氢钾复合盐，固体过氧化氢，过氧化钙等类似。藻类管理的目标就是要维持藻类多样性，防止出现一藻独大”、促使养殖水体中藻类连续稳定，既不能疯生疯长，又不能缺失断档，维护水体中藻类的生态功能正常运行。要达到上述藻类管理的目标，需要做好以下两项基本

1，避免形成藻类营养限制

在藻类有可能出现营养限制之前，要及时地为藻类提供所需营养。夏秋高温季节，正是藻类旺盛生长的时期。在晴朗天气的中午时分，藻类光合作用强烈，增殖迅猛，需要消耗大量的营养物质。而由于水温造成的水体上下分层现象， 致使下底层沉积的营养物质无法补充到上表层，此时就会造成局部的营养物质缺乏，导致上表水层的藻类出现营养限制，老化而大量死亡。所以，在晴朗天气的中午时分，当藻类有可能出现营养限制之前，采取措施，打破水体上下分层，促进上下水体交流，促使底泥再悬浮营养再释放，使沉积在下底层的营养物质及时补充到上表层，打破藻类的营养限制，这是藻类管理科学的、非常有效的措施。

2，避免藻类的疯生疯长

避免藻类泛滥，科学、正确的应对措施就是维持藻类生长与被牧食消费之间的平衡。食物链（网）中藻类下游有原生动物、浮游动物、水生昆虫及幼虫、底栖动物等，以及滤食性鱼类。这些牧食藻类的链节中，原生动物、浮游动物等也是水中自然而生的生物，而滤食性鱼类是人为放养的，目的就是调节藻类生长与被牧食消费之间的平衡。而在实际生产中，频繁向池塘泼洒杀虫剂，杀灭原生动物和浮游动物等，致使食物链（网）链节缺失中断，牧食藻类的环节缺失中断，直接导致藻类泛滥成灾，引发池塘水体生态系统紊乱造成灾难。至于搭配放养一些滤食鱼类来调节藻类与原生动物、浮游动物的生物量这一管理环节，也远远没有做到合理科学。